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我校圓滿完成海南省2021年第二例本土新冠肺炎確診病例測序工作

8月5日,按照海南省新冠疫情防控工作指揮部統一部署和要求,盡快開展??谑?月份新增的第二例本地新冠肺炎病例(輕型)病毒的測序及溯源工作。學校黨委高度重視,黨委書記楊俊、校長趙建農第一時間指示新冠病毒測序小組火速集結,快速高質完成本次測序與溯源任務。

8月5日上午11點30分,新冠核酸病毒樣本C2T和Lin-1由我校第一附屬醫院轉運中心專人專車(彌龍、任廣旭)分別從海南省疾控中心和??谑屑部刂行倪\送至海南醫學院校門口,與等候在此的呂志躍副校長進行簽字交接,然后由專人送至我校P2實驗室。測序成員張云霞、易國輝、方星悅立即啟動樣本測序工作,16點30分完成富集,19點完成建庫、質檢、上機工作。

8月6日上午12點30分,獲得全部測序數據并即刻送達數據分析室。生物信息學分析小組人、機24小時待命,李永生、尹飛飛、潘濤首先拼接基因組,用海量的信息還原本株新冠病毒的真面目。獲得新冠毒株基因組序列后,與國際標準株和我國發布的最新Delta株基因組信息進行比對,查找特異性突變位點并利用遺傳進化樹進行溯源。數據分析小組謹慎對待每一個檢測出來的突變位點,從原始數據到國內外相關文獻報道,多方法論證測序毒株的株系和特點,數據分析結果由專家小組進行兩輪審核,并于下午15點得出詳細的數據分析結果和初步結論。最后由測序小組執行組長呂志躍副校長進行仔細解讀及認真審核,確認海南今年第二例輸入性本土新冠陽性患者感染新冠病毒同為印度Delta株,并基于國家疾病預防控制中心、??谑屑膊☆A防控制中心、公共衛生學院張帆副院長(美蘭機場疫情防控工作專家組成員)提供的江蘇南京疫情代表株序列比對及流行病學調查結果,推斷該Delta株與俄羅斯輸入病例有關聯。8月6日16點,學校向省疫情防控指揮部和省衛健委分別報送了正式檢測報告及支撐材料。

本次測序是海南醫學院新冠病毒測序小組繼8月2日圓滿完成海南省2021年首例外省輸入本土新冠肺炎確診病例測序任務后,再次高質量完成了省疫情指揮部交辦的測序任務。在保證準確性和科學性的前提下,測序小組成員們爭分奪秒,各環節有條不紊,一氣呵成,其結果為海南近期連續出現2例輸入性本地病例的情況下,新冠疫情傳播流行風險評估及制定精準有效防控策略提供關鍵科學證據,充分展現了海南醫學院在疫情再現時,勇擔當、敢奉獻的精神!

 

視頻

新冠核酸病毒樣本轉運至我校P2實驗室

新冠病毒測序專家組成員有序推進確診病例基因測序工作 (一)

新冠病毒測序專家組成員有序推進確診病例基因測序工作 (二)

新冠病毒測序專家上機測序分析

 

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